V období 2014-2020 je prioritou programu spolupráce Rakousko – Česká republika posílení udržitelného inovativního ekonomického rozvoje programového území v přehraniční dimenzi. Programové území je vymezeno regiony NUTSIII. Nově již neplatí pravidlo, které omezovalo u vzdálenějších rakouských regionů alokovat max. 20 % prostředků Programu, a rakouské regiony jsou zahrnuty do programového území bez omezení.
Česká republika: Jihočeský kraj, Kraj Vysočina, Jihomoravský kraj
Rakousko: Mostviertel-Eisenwurzen, Sankt Pölten, Waldviertel, Weinviertel, Wienr Umland-Nordteil, Wien, Innviertel, Linz-Wels, Mühlviertel, Steyr-Kirchdorf.Plánovaný rozpočet programu činí 97 mil. EUR ERDF prostředků.