Od července 2014, kdy vláda schválila návrhy operačních programů, probíhá oficiální vyjednávání s Evropskou
komisí o podobě a zaměření jednotlivých programů. Dle pravidel daných evropskou legislativou je Komise
posuzuje z pohledu připravenosti a souladu s prioritami EU i cíli, ke kterým se Česká republika zavázala
v rámci stěžejního strategického dokumentu pro čerpání fondů – Dohodě o partnerství.